2008年12月底，同方股份在北京市一中院对清芯光电提起诉讼，要求后者偿还6600余万元欠款，并在起诉的同时申请了诉讼财产保全，将清芯光电几乎全部资产进行司法查封。

　　实际上，同方股份的诉讼针对的是清芯光电韩方股东TATCo.Ltd。而此前TATCo也向廊坊经济技术开发区人民法院提起针对同方股份的诉讼。TATCo认为，同方股份应将所融的LED项目资金投入清芯光电，而非同方光电，它认为后者是清芯光电二期工程，同方股份不应独资。

　　原来，在同方股份公布募资方案之前的2008年3月22日，清芯光电曾召开董事会，通过了“关于在北京市顺义区天竺生产基地投资建设及设立子公司的决议。”

　　决议约定：由同方股份出资购买45台MOCVD配套生产设备、配套设施及提供相关流动资金，在北京天竺国家级出口加工区投资建设清芯二期生产基地;建成后，资产全部转移至清芯光电，相当于同方股份借款给清芯光电建立天竺生产基地。

　　按约定，同方股份应在2008年8月底前，完成15台MOCVD配套设备及相关流动现金;剩余30台在2009年8月底前完成。

　　而资产转移方式则包括：1)清芯光电在天竺设立子公司;2)天竺公司经营获利后，按照原值，购回资产，即可以按照折旧等值逐年购买;3)清芯光电根据同方股份垫资资金占用情况(扣除购回的资产额)，在年底核定投资额，按照年回报率12%，以红利方式支付给同方借款利息。

　　此外，其中为回避证监会、税务和财务处理的问题，同方股份在清芯天竺子公司中参股，参股额以能够支付利息为限，其参股目的仅限于获得利息，一旦利息结算完毕，同方股份无条件退出。

　　不过，2008年5月份配股融资方案实施后，同方股份并没有按照该协议，将所融资金投入清芯光电。